关于他在乌鲁木齐的住处，有九家湾、水磨沟、鉴湖亭等说法。细细考证，全说错了。从纪晓岚的诗文中，可知他当时住在以今天的大小十字为中心、并设南北东西诸门的乌鲁木齐汉城（即迪化城）内。而九家湾是汉城西北十余里的民户屯田区。汉城以西约十里、九家湾南邻的满城（即巩宁城，今称老满城），则建于乾隆三十七年（１７７２年），即纪晓岚离开新疆的第二年。水磨沟当时称温泉，纪晓岚吟道：“界破山光一片青，温暾流水碧泠泠。游人倘有风沂兴，只向将军借幔亭。”注说：“温泉在城北十余里，硫泉也。上无屋覆，浴必支帐”（《乌鲁木齐杂诗·风土》九）。以后这里才出现房屋水磨，称为水磨沟。由此可见，纪晓岚是绝不会住在当时还没出现的满城，也不会住在九家湾和水磨沟的。水磨沟今辟为公园，园中有一纪晓岚手持烟袋的布衣全身塑像。

    今天乌鲁木齐人民公园（因位于又称西公园）鉴湖中有一座湖心小楼，题额“鉴湖亭”。有人说这是纪晓岚的阅微草堂。但在《阅微草堂笔记》中，人民公园一带当时是这番情景：“余至乌鲁木齐，城西有深林，老木参云，弥亘数十里。”前将军伍公弥泰建一亭于中题曰：秀野（《滦阳消夏录》一）。“昌吉叛乱之时，捕获逆党，皆戮于迪化城西树林中”。自注：“迪化即乌鲁木齐，今建为州。树林绵亘数十里，俗谓之树窝”《滦阳消夏录》三。他又记夏日散步乌鲁木齐城外，因至秀野亭纳凉，坐稍久竟遇鬼，狼狈奔回。分析原因：“盖亭在城西深林，万木参天，仰不见日。旅榇之浮厝者，罪人之伏法者，皆在是地，往往能为变怪云”《滦阳消夏录》四。他在《乌鲁木齐杂诗》中亦吟：“秀野亭西绿树窝，杖藜携酒晚春多。谯楼鼓动栖鸦睡，尚有游人踏月歌”（《游览》一）。